A SC23 konferenciaA hónap elején megtartott rendezvény megdöntötte a korábbi közönségrekordokat: több mint 14,000 XNUMX látogató indult Denverbe, hogy tájékozódjon a nagy teljesítményű számítástechnika (HPC) legújabb eredményeiről. Mint minden évben, a konferencia is számos előadásnak adott otthont, amelyek lehetővé tették a tudósok számára, hogy megvitassák, hogy a szuperszámítástechnika milyen pozitív hatással volt területükre.
Mivel a HPC szinte minden tudományterületen felbecsülhetetlen értékű, a biológiai vizsgálatok jól szerepeltek az SC23-on. Az egyik különösen érdekes tanulmány az előadása volt Sayan Roychowdhury a kutatási cikk alapjánAz adaptív fizika finomítási szimulációk javítása valósághű vörösvérsejtszámok hozzáadásával. "
A főként a Duke Egyetem tudósai, valamint az Oak Ridge National Laboratory és a Lawrence Livermore National Laboratory kutatói által írt cikk a rákos sejtek felső keringési rendszeren keresztüli transzportjának szimulációira összpontosít. Roychowdhury magyarázata szerint a fő probléma az, hogy milyen messzire jutnak el a rákos sejtek ahhoz képest, hogy milyen kicsik.
„[A rák] eltéríti az egész testet összekötő rendszert – a keringési rendszert” – mondta Roychowdhury a küldötteknek. SC23 bemutató. „Ezek a rákos sejtek mikron nagyságrendűek, talán több tíz mikron is. A megtett távolságot azonban méterben mérik. A rákos sejtek nagy távolságokra történő transzportját vizsgáljuk.”
A hibrid CPU–GPU (központi feldolgozóegység–grafikus feldolgozó egység) architektúrára támaszkodva a Csúcs szuperszámítógép – beleértve az 1500 GPU-t és 10,800 XNUMX CPU-t – a csapat bővíteni tudta adaptív fizika finomítás (APR) módszerrel nyomon követhető egy egyedi rákos sejt, amint az a véráramban mozog.
Különböző felbontások a különböző eredményekhez
A rákkal kapcsolatos számos aggodalom között az egyik fő kérdés az, hogy a rákos sejtek hogyan tudnak áttétet képezni és elterjedni a szervezetben. Amint a kutatók közleményükben rámutatnak, a rákkal összefüggő halálozások több mint 90%-ának hátterében a metasztázis áll.
A folyamat további megértése érdekében a kutatók az APR-módszert alkalmazták a vörösvértestek finom felbontású régiójának egy durván felbontott ömlesztett folyadékdoménnel való kombinálására. Lényegében egy rácsot vettek fel, amely a vörösvértestek nagy felbontású modelljét képviselte, és áthelyezték a felsőtest érrendszerének szimulált kis felbontású változatán. A számítási architektúra hibrid jellege itt fontos volt, mivel a CPU-kat a durván felbontott környező területhez használták, míg a GPU-k a finoman felbontott gridre összpontosítottak.
Ez a rács tartalmazta a rákos sejtet, valamint az azt körülvevő vörösvértestek nagy felbontású modelljét, amikor a keringési rendszerben mozog. Ahogy a rákos sejt mozgott, a rács is együtt mozgott vele. Ez a megközelítés biztosította, hogy az apró rákos sejtet körülvevő területet a lehető legfinomabban modellezzék anélkül, hogy a számítási erőforrásokat pazarolták volna a keringési rendszer azon területeire, amelyek nem közvetlenül veszik körül a rákos sejtet.
Ennek a munkának sok más fontos szempontja is volt, beleértve a vörösvértestek pontos deformációját, miközben átfolynak a keringési rendszeren, valamint a finom felbontású rács és a rácson kívüli durva felbontású terület közötti határvonalat.
A lágyanyag-fizika segít feltárni, hogy a rák terjedésének valószínűsége
Roychowdhury megjegyezte, hogy ennek a kutatásnak az egyik legjelentősebb pontja, hogy a fejlett APR módszerrel szimulálható a rákos sejtek transzportja a teljesen feloldott modell futtatásához szükséges számítási teljesítmény töredékével. „Egy ilyen szimuláció, amelynek több ezer csomópontot kellene igénybe vennie, le lehet zsugorítani, hogy csak egyet használjunk” – mondta. "Célunk, hogy ezeket a HPC-szimulációkat hozzáférhetővé tegyük a tudósok számára."
Van tennivaló a jövőben. A csapat jelenlegi kutatása csak egyetlen rákos sejtre összpontosít, miközben ezek a sejtek általában csoportokba esnek, nem pedig egyenként. A hallgatóság kérdésére válaszolva Roychowdhury kijelentette, hogy a csapatot ezen a területen is érdeklik a sarlósejtekkel kapcsolatos további kutatások.
- SEO által támogatott tartalom és PR terjesztés. Erősödjön még ma.
- PlatoData.Network Vertical Generative Ai. Erősítse meg magát. Hozzáférés itt.
- PlatoAiStream. Web3 Intelligence. Felerősített tudás. Hozzáférés itt.
- PlatoESG. Carbon, CleanTech, Energia, Környezet, Nap, Hulladékgazdálkodás. Hozzáférés itt.
- PlatoHealth. Biotechnológiai és klinikai vizsgálatok intelligencia. Hozzáférés itt.
- Forrás: https://physicsworld.com/a/modelling-a-single-cancer-cell-in-a-sea-of-blood/
- :is
- :nem
- 000
- 10
- 14
- 160
- 425
- a
- Képes
- Rólunk
- hozzáférhető
- Fiók
- pontos
- eredmények
- ACM
- adaptív
- mellett
- fejlett
- megengedett
- mentén
- Is
- an
- és a
- alkalmazott
- megközelítés
- április
- építészet
- VANNAK
- TERÜLET
- területek
- művészi
- AS
- szempontok
- At
- résztvevők
- közönség
- Szerző által
- alapján
- BE
- között
- vér
- test
- határ
- szünet
- Törött
- by
- TUD
- Rák
- Ráksejtek
- Okoz
- Cellák
- központi
- kettyenés
- CO
- össze
- jön
- képest
- számítási
- számítási teljesítmény
- Kiszámít
- számítástechnika
- vonatkozó
- aggodalmak
- Konferencia
- összeköt
- tartalmazott
- teremt
- Jelenlegi
- küldöttek
- Denver
- részletes
- különböző
- megvitatni
- távolság
- domain
- csinált
- le-
- Herceg
- herceg egyetem
- Korábban
- biztosítani
- Egész
- lényeg
- Minden
- magyarázható
- terjed
- messze
- Fields
- Találjon
- áramlási
- folyadék
- összpontosított
- koncentrál
- A
- töredék
- ból ből
- teljesen
- további
- jövő
- általában
- cél
- GPU
- Rács
- he
- Cím
- hős
- segít
- itt
- nagy teljesítményű
- nagy felbontású
- övé
- házigazdája
- Hogyan
- azonban
- hpc
- HTTPS
- hibrid
- IEEE
- kép
- azonnali
- azonnal
- befolyásolta
- fontos
- in
- Beleértve
- egyéni
- információ
- kölcsönhatások
- kamat
- érdekelt
- felbecsülhetetlen
- kérdés
- IT
- Jackson
- jpg
- éppen
- laboratórium
- legutolsó
- Lawrence
- Előadás
- előadások
- mint
- Valószínű
- Hosszú
- keres
- Fő
- fontos
- csinál
- sok
- max-width
- talán
- módszer
- Több millió
- modell
- modellezés
- Hónap
- a legtöbb
- többnyire
- áthelyezve
- mozog
- nemzeti
- Természet
- Szükség
- csomópontok
- neves
- tölgy
- Oak Ridge Nemzeti Laboratórium
- of
- kedvezmény
- on
- ONE
- csak
- nyitva
- érdekében
- ORNL
- Más
- ki
- kívül
- felett
- Papír
- különös
- Fizika
- Fizika Világa
- Plató
- Platón adatintelligencia
- PlatoData
- pont
- pont
- pozitívan
- lehetséges
- hatalom
- bemutatott
- ajándékot
- előző
- folyamat
- feldolgozás
- kérdés
- Inkább
- valószerű
- nyilvántartások
- Piros
- vidék
- képviselők
- kötelező
- kutatás
- kutatók
- megoldódott
- Tudástár
- válaszol
- mutatják
- futás
- Mondott
- tudományos
- tudósok
- SEA
- Úgy tűnik,
- kellene
- jelentős
- tettetés
- egyetlen
- kicsi
- terjedése
- meghatározott
- folyam
- tanulmányok
- Tanulmány
- Szuperszámítógép
- környező
- rendszer
- Vesz
- csapat
- tíz
- mint
- hogy
- A
- A terület
- azok
- Ezek
- ők
- ezt
- ezer
- Keresztül
- egész
- miniatűr
- nak nek
- mondta
- vett
- vágány
- Csomagkövetés
- szállítható
- utazás
- igaz
- mögöttes
- megért
- egység
- egyetemi
- használ
- használt
- segítségével
- fajta
- változat
- fontos
- volt
- JÓL
- voltak
- amikor
- vajon
- míg
- val vel
- nélkül
- Munka
- világ
- év
- zephyrnet