Weill Cornell Medicine และนักวิจัยจาก New York Genome Center ร่วมกับ Oxford Nanopore Technologies ได้พัฒนาวิธีการใหม่ในการประเมินโครงสร้างสามมิติของจีโนมมนุษย์ในวงกว้าง หรือลักษณะการพับของจีโนม จีโนมเป็นชุดคำสั่งทางพันธุกรรมที่สมบูรณ์ DNA หรือ RNA ทำให้สิ่งมีชีวิตสามารถทำงานได้
การใช้วิธีนี้ นักวิจัยได้แสดงให้เห็นว่าการทำงานของเซลล์ รวมทั้งการแสดงออกของยีน อาจได้รับผลกระทบจากกลุ่มขององค์ประกอบควบคุมที่มีปฏิสัมพันธ์พร้อมกันในจีโนมมากกว่าคู่ของส่วนประกอบเหล่านี้
พวกเขาใช้การจัดลำดับนาโนพอร์ในระดับจีโนม
การทดลองในอนาคตจะสำรวจว่าการจัดกลุ่มเฉพาะขององค์ประกอบจีโนมใดที่จำเป็นสำหรับแง่มุมต่างๆ ของเอกลักษณ์ของเซลล์ เทคโนโลยีใหม่นี้อาจช่วยให้นักวิจัยเข้าใจว่าสเต็มเซลล์ เซลล์ที่ยังไม่บรรลุนิติภาวะ มาสเตอร์เซลล์ของร่างกาย แยกออกเป็นเซลล์ประเภทต่าง ๆ ได้อย่างไร
นักวิจัยอาจเข้าใจความผิดปกติในเซลล์มะเร็งได้ดีขึ้น
นามธรรม
การมีปฏิสัมพันธ์แบบสามมิติ (3D) ที่มีลำดับสูงระหว่างตำแหน่งจีโนมมากกว่าสองแห่งนั้นพบได้ทั่วไปในโครมาตินของมนุษย์ แต่บทบาทของพวกมันในการควบคุมยีนนั้นไม่ชัดเจน การทดสอบโครมาติน 3 มิติที่มีลำดับสูงก่อนหน้านี้อาจวัดการโต้ตอบระยะไกลระหว่างจีโนมหรือการโต้ตอบใกล้เคียงที่เป้าหมายที่เลือก เพื่อแก้ไขช่องว่างนี้ เราได้พัฒนา Pore-C ซึ่งรวมการจับโครงสร้างโครมาตินเข้ากับการจัดลำดับนาโนพอร์ของคอนคาเมอร์เพื่อสร้างโปรไฟล์ผู้ติดต่อโครมาตินที่มีลำดับสูงใกล้เคียงกันในระดับจีโนม เรายังได้พัฒนาวิธีการทางสถิติ Chromunity เพื่อระบุชุดของตำแหน่งจีโนมที่มีความถี่ของการติดต่อที่มีลำดับสูงซึ่งสูงกว่าพื้นหลังอย่างมีนัยสำคัญ ('การทำงานร่วมกัน') เมื่อใช้วิธีการเหล่านี้กับสายเซลล์ของมนุษย์ เราพบว่าการทำงานร่วมกันได้รับการเสริมประสิทธิภาพในเอนแฮนเซอร์และโปรโมเตอร์ในโครมาตินที่ออกฤทธิ์และในยีนที่มีการถ่ายทอดและกำหนดสายเลือดสูง ในเซลล์มะเร็งต่อมลูกหมาก สิ่งเหล่านี้รวมถึงตำแหน่งการจับของปัจจัยการถอดรหัสที่ขับเคลื่อนด้วยแอนโดรเจนและโปรโมเตอร์ของยีนที่ควบคุมด้วยแอนโดรเจน คอนคาเมเมอร์ของผู้ติดต่อที่มีลำดับสูงในยีนที่แสดงออกอย่างสูงถูกดีเมทิลที่สัมพันธ์กับการสัมผัสแบบคู่ที่ตำแหน่งเดียวกัน การทำงานร่วมกันในเซลล์มะเร็งเต้านมเกี่ยวข้องกับไทโฟนา ซึ่งเป็นกลุ่มของแอมพลิคอนดีเอ็นเอที่ซับซ้อน ผลลัพธ์เหล่านี้เชื่อมโยงการโต้ตอบ 3D ที่มีลำดับสูงทั่วทั้งจีโนมเข้ากับโปรแกรมการถอดรหัสที่กำหนดเชื้อสาย และสร้าง Pore-C และ Chromunity เป็นวิธีการที่ปรับขนาดได้เพื่อประเมินโครงสร้างจีโนมที่มีลำดับสูง
Brian Wang เป็นผู้นำทางความคิดแห่งอนาคตและบล็อกเกอร์วิทยาศาสตร์ยอดนิยมที่มีผู้อ่าน 1 ล้านคนต่อเดือน บล็อก Nextbigfuture.com ของเขาอยู่ในอันดับที่ 1 บล็อกข่าววิทยาศาสตร์ ครอบคลุมเทคโนโลยีและแนวโน้มที่ก่อกวนมากมาย เช่น อวกาศ วิทยาการหุ่นยนต์ ปัญญาประดิษฐ์ การแพทย์ เทคโนโลยีชีวภาพต่อต้านวัย และนาโนเทคโนโลยี
เขาเป็นที่รู้จักในด้านการระบุเทคโนโลยีล้ำสมัย ปัจจุบันเขาเป็นผู้ร่วมก่อตั้งบริษัทสตาร์ทอัพและผู้ระดมทุนสำหรับบริษัทระยะเริ่มต้นที่มีศักยภาพสูง เขาเป็นหัวหน้าฝ่ายวิจัยเพื่อการจัดสรรสำหรับการลงทุนด้านเทคโนโลยีระดับลึกและเป็น Angel Investor ที่ Space Angels
เขาเป็นวิทยากรประจำในองค์กร เขาเป็นวิทยากร TEDx เป็นวิทยากรของ Singularity University และเป็นแขกรับเชิญในการสัมภาษณ์หลายครั้งทางวิทยุและพอดแคสต์ เขาเปิดให้พูดในที่สาธารณะและให้คำปรึกษา
