Weill Cornell Medicine ve New York Genom Merkezi araştırmacıları, Oxford Nanopore Technologies ile işbirliği içinde, insan genomunun üç boyutlu yapısını veya genomun nasıl katlandığını büyük ölçekte değerlendirmek için yeni bir yöntem geliştirdi. Genom, bir organizmanın işlev görmesini sağlayan genetik talimatların (DNA veya RNA) tamamıdır.
Bu yöntemi kullanarak araştırmacılar, gen ekspresyonu da dahil olmak üzere hücre fonksiyonunun, bu bileşenlerin çiftlerinden ziyade, genomdaki eşzamanlı olarak etkileşime giren düzenleyici element gruplarından etkilenebileceğini gösterdi.
Genom ölçekli nanogözenek dizilimini kullandılar.
Gelecekteki deneyler, hücre kimliğinin çeşitli yönleri için hangi spesifik genomik bileşen gruplarının gerekli olduğunu keşfedecektir. Yeni teknoloji aynı zamanda araştırmacıların vücudun olgunlaşmamış ana hücreleri olan kök hücrelerin farklı hücre tiplerine nasıl farklılaştığını anlamalarına da yardımcı olabilir.
Araştırmacılar kanser hücrelerindeki anormallikleri daha iyi anlayabilirler.
Özet
İkiden fazla genomik lokus arasındaki yüksek dereceli üç boyutlu (3D) etkileşimler insan kromatininde yaygındır, ancak gen düzenlemesindeki rolleri belirsizdir. Önceki yüksek dereceli 3D kromatin analizleri, genom boyunca uzak etkileşimleri veya seçilen hedeflerdeki yakın etkileşimleri ölçer. Bu boşluğu gidermek için, genom ölçeğinde proksimal yüksek dereceli kromatin temaslarının profilini çıkarmak için kromatin konformasyon yakalamasını konkatemerlerin nano gözenek dizilimi ile birleştiren Pore-C'yi geliştirdik. Ayrıca, arka plandan ('sinerjiler') önemli ölçüde daha yüksek yüksek dereceli temas frekanslarına sahip genomik lokus kümelerini tanımlamak için Chromunity istatistiksel yöntemini geliştirdik. Bu yöntemleri insan hücre hatlarına uygulayarak, aktif kromatindeki güçlendiriciler ve promoterler ile yüksek oranda kopyalanmış ve soy tanımlayan genlerde sinerjilerin zenginleştiğini bulduk. Prostat kanseri hücrelerinde bunlar, androjenle yönlendirilen transkripsiyon faktörlerinin bağlanma bölgelerini ve androjenle düzenlenen genlerin destekleyicilerini içeriyordu. Yüksek düzeyde eksprese edilen genlerdeki yüksek dereceli temasların konkatemerleri, aynı lokuslardaki ikili temaslara göre demetile edilmiştir. Meme kanseri hücrelerindeki sinerjiler, karmaşık DNA amplikonlarının bir sınıfı olan tyfonas ile ilişkilendirildi. Bu sonuçlar, genom çapında yüksek dereceli 3 boyutlu etkileşimleri soy tanımlayan transkripsiyonel programlara titizlikle bağlar ve Pore-C ve Chromunity'yi yüksek dereceli genom yapısını değerlendirmek için ölçeklenebilir yaklaşımlar olarak kurar.
Brian Wang, Fütürist Düşünce Lideri ve ayda 1 milyon okuyucusu olan popüler bir Bilim blog yazarıdır. Blogu Nextbigfuture.com, Science News Blog'da 1. sırada yer alıyor. Uzay, Robotik, Yapay Zeka, Tıp, Yaşlanma Karşıtı Biyoteknoloji ve Nanoteknoloji dahil olmak üzere birçok yıkıcı teknoloji ve trendi kapsar.
En son teknolojileri tanımlamasıyla tanınan, şu anda yüksek potansiyele sahip erken aşamadaki şirketler için bir başlangıç ve bağış toplama kuruluşunun Kurucu Ortağıdır. Derin teknoloji yatırımları için Tahsis Araştırma Başkanı ve Space Angels'ta Melek Yatırımcıdır.
Şirketlerde sık sık konuşmacı olarak, TEDx konuşmacısı, Singularity Üniversitesi konuşmacısı ve radyo ve podcast'ler için çok sayıda röportajda konuk olmuştur. Topluluk önünde konuşma ve danışmanlık görüşmelerine açıktır.
