Các nhà nghiên cứu của Weill Cornell Medicine và New York Genome Centre, phối hợp với Oxford Nanopore Technologies, đã phát triển một phương pháp mới để đánh giá trên quy mô lớn cấu trúc ba chiều của bộ gen người, hoặc cách bộ gen gấp lại. Bộ gen là tập hợp đầy đủ các chỉ dẫn di truyền, DNA hoặc RNA, cho phép một sinh vật hoạt động.
Sử dụng phương pháp này, các nhà nghiên cứu đã chứng minh rằng chức năng tế bào, bao gồm biểu hiện gen, có thể bị ảnh hưởng bởi các nhóm yếu tố điều tiết tương tác đồng thời trong bộ gen chứ không phải các cặp thành phần này.
Họ đã sử dụng giải trình tự chuỗi nano ở quy mô bộ gen.
Các thí nghiệm trong tương lai sẽ khám phá các nhóm cụ thể của các thành phần bộ gen nào cần thiết cho các khía cạnh khác nhau của nhận dạng tế bào. Công nghệ mới cũng có thể giúp các nhà nghiên cứu hiểu được cách thức tế bào gốc, tế bào chủ chưa trưởng thành của cơ thể, phân hóa thành các loại tế bào khác nhau.
Các nhà nghiên cứu có thể hiểu rõ hơn về những bất thường trong tế bào ung thư.
Tóm tắt
Tương tác ba chiều (3D) bậc cao giữa hơn hai locus bộ gen là phổ biến trong chất nhiễm sắc của người, nhưng vai trò của chúng trong điều hòa gen là không rõ ràng. Các xét nghiệm chất nhiễm sắc 3D bậc cao trước đây hoặc đo lường các tương tác xa trên bộ gen hoặc các tương tác gần tại các mục tiêu đã chọn. Để giải quyết khoảng trống này, chúng tôi đã phát triển Pore-C, kết hợp giữa việc thu giữ cấu trúc nhiễm sắc với việc giải trình tự lỗ nano của các chất nối để xác định các điểm tiếp xúc nhiễm sắc bậc cao gần ở quy mô bộ gen. Chúng tôi cũng phát triển phương pháp thống kê Sắc độ để xác định các tập hợp locus bộ gen có tần số tiếp xúc bậc cao cao hơn đáng kể so với nền ('hiệp lực'). Áp dụng các phương pháp này cho các dòng tế bào của con người, chúng tôi nhận thấy rằng sự cộng hưởng được làm giàu trong các chất tăng cường và chất xúc tiến trong chất nhiễm sắc hoạt động và trong các gen được phiên mã và xác định dòng dõi cao. Trong các tế bào ung thư tuyến tiền liệt, chúng bao gồm các vị trí liên kết của các yếu tố phiên mã do androgen điều khiển và các yếu tố thúc đẩy các gen điều chỉnh androgen. Các liên hệ của các tiếp điểm bậc cao trong các gen được biểu hiện cao đã bị khử methyl so với các tiếp điểm theo cặp ở cùng một locus. Hợp lực trong các tế bào ung thư vú có liên quan đến tyfonas, một loại amplicon DNA phức tạp. Những kết quả này liên kết chặt chẽ các tương tác 3D bậc cao trên toàn bộ bộ gen với các chương trình phiên mã xác định dòng dõi và thiết lập Pore-C và Chromunity như các phương pháp tiếp cận có thể mở rộng để đánh giá cấu trúc bộ gen bậc cao.
Brian Wang là một nhà lãnh đạo tư tưởng theo chủ nghĩa tương lai và là một blogger Khoa học nổi tiếng với 1 triệu độc giả mỗi tháng. Blog của anh ấy Nextbigfuture.com được xếp hạng # 1 Blog Tin tức Khoa học. Nó bao gồm nhiều công nghệ và xu hướng đột phá bao gồm Không gian, Người máy, Trí tuệ nhân tạo, Y học, Công nghệ sinh học chống lão hóa và Công nghệ nano.
Được biết đến với việc xác định các công nghệ tiên tiến, anh hiện là Đồng sáng lập của một công ty khởi nghiệp và gây quỹ cho các công ty giai đoạn đầu tiềm năng cao. Ông là Trưởng bộ phận Nghiên cứu Phân bổ cho các khoản đầu tư công nghệ sâu và là Nhà đầu tư Thiên thần tại Space Angels.
Là một diễn giả thường xuyên tại các tập đoàn, anh ấy đã từng là diễn giả của TEDx, diễn giả của Đại học Singularity và là khách mời trong nhiều cuộc phỏng vấn cho đài phát thanh và podcast. Anh ấy sẵn sàng nói trước công chúng và tư vấn cho các cam kết.
