টিস্যুতে সেলুলার ফাংশন স্থানীয় পরিবেশের উপর নির্ভরশীল। একটি টিস্যুর মধ্যে তাদের সঠিক অবস্থান অর্জন করার সময় কোষের আণবিক বৈশিষ্ট্যগুলির ম্যাপিং রোগটি আরও ভালভাবে বোঝার জন্য অপরিহার্য।
স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টোমিক্সের উত্থান জিনোম-স্কেল জিন এক্সপ্রেশন ম্যাপিংকে সক্ষম করেছে। তবুও, সেলুলার স্তর এবং জিনোম স্কেলে টিস্যুর স্থানিক এপিজেনেটিক তথ্য ক্যাপচার করার ক্ষমতার অভাব রয়েছে। এখন, একটি দল ইয়েল এবং ক্যারোলিনস্কা ইনস্টিটিউটের গবেষকরা টিস্যু বিভাগগুলির স্থানিকভাবে সমাধান করা ক্রোমাটিন অ্যাক্সেসিবিলিটি প্রোফাইলিংয়ের জন্য একটি প্রযুক্তি তৈরি করেছেন। পদ্ধতিটি বিভিন্ন টিস্যুতে পৃথক কোষের বিশদ আণবিক অ্যাটলেস তৈরি করতে সহায়তা করতে পারে এবং রোগগুলি কীভাবে বিকাশ করে তা আরও ভালভাবে বোঝার লক্ষ্য।
পদ্ধতি কোন অঞ্চলের সংজ্ঞায়িত করে ক্রোমাটিন একটি টিস্যুর নির্দিষ্ট স্থানে কোষে জিনোম-ব্যাপী অ্যাক্সেসযোগ্য।
জিন সক্রিয়করণের জন্য এই ক্রোমাটিন অ্যাক্সেসিবিলিটি প্রয়োজন, যা কোনো নির্দিষ্ট কোষের আণবিক অবস্থার মধ্যে স্বতন্ত্র অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে। কোষের পরিচয়, কোষের অবস্থা এবং জিনের অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণকারী অন্তর্নিহিত প্রক্রিয়াগুলি বোঝার ক্ষেত্রে একটি উল্লেখযোগ্য অগ্রগতি - নামে পরিচিত epigenetics - বিভিন্ন টিস্যু বা রোগের বিকাশে কোষের স্থানিক অবস্থানের সাথে ক্রোমাটিন অ্যাক্সেসযোগ্যতার বিশ্লেষণকে একত্রিত করার ক্ষমতা।
ইয়েলের বায়োমেডিকেল ইঞ্জিনিয়ারিংয়ের অধ্যাপক রং ফ্যান বলেন, "এখন আমরা ক্রোমাটিন অ্যাক্সেসিবিলিটির উপর ভিত্তি করে একটি স্থানিক কোষ অ্যাটলাস তৈরি করতে কোষের প্রকারগুলি সনাক্ত করতে পারি৷ কোষের অবস্থার আরও ভালো সংজ্ঞা বা কোষের ধরন আবিষ্কারের জন্য আমরা সরাসরি এপিজেনেটিক স্তরে কোষের ধরন দেখতে পারি।"
বিজ্ঞানীরা 'spatial-ATAC-seq' নামে একটি পদ্ধতি ব্যবহার করে মাউস এবং মানুষের উভয় টিস্যু প্রোফাইল করেছেন৷ মস্তিষ্কের টিস্যুতে এই পদ্ধতিটি ব্যবহার করে বিজ্ঞানীদের মস্তিষ্কের বিভিন্ন অঞ্চল কতটা জটিলভাবে বিকশিত হয় তা দেখতে অনুমতি দেয়। ইমিউন কোষের প্রকারের সংগঠনের অন্তর্দৃষ্টি পেতে, তারা এটি মানুষের টনসিল টিস্যুতেও প্রয়োগ করেছিল।
ভক্ত বলেছেন, "আমরা একটি নিরপেক্ষ বৈশ্বিক দৃষ্টিভঙ্গি পাব, এবং সমস্ত সম্ভাব্য কোষের অবস্থার আরও সূক্ষ্ম রেজোলিউশন ভিউ, এবং আরও গুরুত্বপূর্ণভাবে, তারা টিস্যুতে কোথায় আছে তা 'দেখুন'৷ এটি সেল ম্যাপ এবং সেল অ্যাটলেস তৈরির জন্য একটি শক্তিশালী হাতিয়ার।"
ইয়ানজিয়াং ডেং, ফ্যানের ল্যাবের পোস্টডক্টরাল সহযোগী এবং গবেষণার প্রধান লেখক বলেছেন যে নতুন পদ্ধতি ব্যবহার করে, তারা তাদের স্থানীয় অবস্থানে মাউসের মস্তিষ্কের টিস্যুতে কোষের ধরণের এপিজেনোম সনাক্ত করতে পারে।"
ক্যারোলিনস্কা ইনস্টিটিউটের গ্লিয়াল সেল বায়োলজির অধ্যাপক গনকালো কাস্তেলো-ব্রাঙ্কো, বলেছেন, "রোগযুক্ত টিস্যুতে স্থানিক ATAC-Seq প্রয়োগ করা অদূর ভবিষ্যতে আমাদের রোগের কুলুঙ্গির পরিপ্রেক্ষিতে নির্দিষ্ট কোষে এপিজেনেটিক অবস্থার মধ্যে রূপান্তর সনাক্ত করার অনুমতি দিতে পারে, যা প্যাথলজিকাল সেলুলার অবস্থার অধিগ্রহণের মধ্যস্থতাকারী আণবিক প্রক্রিয়াগুলির অন্তর্দৃষ্টি দেবে। "
জার্নাল রেফারেন্স:
- ডেং, ওয়াই, বার্তোসোভিক, এম., মা, এস. এট আল। মাউস এবং মানুষের টিস্যুতে ক্রোমাটিন অ্যাক্সেসযোগ্যতার স্থানিক প্রোফাইলিং। প্রকৃতি (2022)। ডিওআই: 10.1038/s41586-022-05094-1
