محققان پزشکی Weill Cornell و مرکز ژنوم نیویورک با همکاری Oxford Nanopore Technologies روش جدیدی را برای ارزیابی در مقیاس بزرگ ساختار سه بعدی ژنوم انسان یا نحوه چین خوردگی ژنوم ایجاد کرده اند. ژنوم مجموعه کاملی از دستورالعمل های ژنتیکی، DNA یا RNA است که یک موجود زنده را قادر به عملکرد می کند.
با استفاده از این روش، محققان نشان دادند که عملکرد سلول، از جمله بیان ژن، ممکن است به جای جفت‌هایی از این اجزا، تحت تأثیر گروه‌هایی از عناصر تنظیم‌کننده همزمان در ژنوم قرار گیرد.
آنها از توالی یابی نانوحفره در مقیاس ژنوم استفاده کردند.
آزمایش‌های آینده بررسی خواهند کرد که کدام گروه‌بندی خاص از اجزای ژنومی برای جنبه‌های مختلف هویت سلولی ضروری است. فناوری جدید همچنین ممکن است به محققان کمک کند تا بفهمند چگونه سلول‌های بنیادی، سلول‌های نابالغ و اصلی بدن، به انواع سلول‌های مختلف تمایز می‌یابند.
محققان ممکن است بهتر بتوانند ناهنجاری های سلول های سرطانی را درک کنند.
بیوتکنولوژی طبیعت - ترکیبات کروماتین سه بعدی درجه بالا از توالی یابی ترکیبی نانوحفره در مقیاس ژنوم
چکیده
فعل و انفعالات سه بعدی (3D) درجه بالا بین بیش از دو مکان ژنومی در کروماتین انسانی رایج است، اما نقش آنها در تنظیم ژن نامشخص است. سنجش‌های کروماتین سه‌بعدی مرتبه بالا قبلی یا برهمکنشهای دور در سراسر ژنوم یا برهمکنشهای پروگزیمال را در اهداف انتخاب شده اندازه‌گیری می‌کنند. برای پرداختن به این شکاف، ما Pore-C را توسعه دادیم که ترکیبی از جذب ترکیب کروماتین با توالی نانو حفره‌های concatemers برای نمایه کردن تماس‌های کروماتین درجه بالا در مقیاس ژنوم است. ما همچنین روش آماری Chromunity را برای شناسایی مجموعه‌ای از مکان‌های ژنومی با فرکانس تماس‌های مرتبه بالا به طور قابل‌توجهی بالاتر از پس‌زمینه ("هم افزایی") توسعه دادیم. با استفاده از این روش‌ها برای رده‌های سلولی انسان، متوجه شدیم که هم افزایی در تقویت‌کننده‌ها و محرک‌های کروماتین فعال و در ژن‌های بسیار رونویسی‌شده و تعیین‌کننده اصل و نسب غنی شده است. در سلول‌های سرطان پروستات، این موارد شامل مکان‌های اتصال فاکتورهای رونویسی مبتنی بر آندروژن و محرک‌های ژن‌های تنظیم‌شده با آندروژن بود. کنتامرهای تماس‌های مرتبه بالا در ژن‌های با بیان بالا نسبت به تماس‌های جفتی در همان مکان‌ها دمیله شدند. هم افزایی در سلول های سرطان سینه با تایفوناس، یک کلاس از آمپلیکون های پیچیده DNA مرتبط بود. این نتایج به‌طور جدی تعاملات سه‌بعدی درجه بالا در سراسر ژنوم را به برنامه‌های رونویسی تعیین‌کننده اصل و نسب پیوند می‌دهند و Pore-C و Chromunity را به عنوان رویکردهای مقیاس‌پذیر برای ارزیابی ساختار ژنوم با مرتبه بالا ایجاد می‌کنند.
برایان وانگ یک اندیشمند آینده نگر و یک وبلاگ نویس محبوب علم با 1 میلیون خواننده در ماه است. وبلاگ وی Nextbigfuture.com در رتبه 1 وبلاگ اخبار علم قرار دارد. این شامل بسیاری از فن آوری ها و روندهای مخرب از جمله فضا ، روباتیک ، هوش مصنوعی ، پزشکی ، بیوتکنولوژی ضد پیری و نانوتکنولوژی است.
او که به دلیل شناسایی فناوری های پیشرفته شهرت دارد ، در حال حاضر یکی از بنیانگذاران یک استارتاپ و جمع آوری کمک های مالی برای شرکت های بالقوه در مراحل اولیه است. او رئیس تحقیقات تخصیص سرمایه گذاری در فناوری عمیق و سرمایه گذار فرشته در Space Angels است.
او یک سخنران مکرر در شرکتها بوده است ، او سخنران TEDx ، سخنران دانشگاه Singularity و مهمان مصاحبه های متعدد برای رادیو و پادکست بوده است. او برای مشارکت عمومی و مشاوره مشارکت دارد.
