L’ADN environnemental est partout. Les scientifiques rassemblent tout.

Republié par Platon

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À la fin du Dans les années 1980, dans un centre de recherche fédéral à Pensacola, en Floride, Tamar Barkay a utilisé la boue d'une manière révolutionnaire qu'elle n'aurait jamais pu imaginer à l'époque : une version rudimentaire d'une technique qui bouleverse aujourd'hui de nombreux domaines scientifiques. Barkay avait collecté plusieurs échantillons de boue, un provenant d'un réservoir intérieur, un autre d'un bayou saumâtre et un troisième d'un marécage d'eau salée de basse altitude. Elle a mis ces échantillons de sédiments dans des bouteilles en verre dans le laboratoire, puis a ajouté du mercure, créant ce qui équivalait à des boues toxiques.

À l'époque, Barkay travaillait pour l'Environmental Protection Agency et elle voulait savoir comment les micro-organismes présents dans la boue interagissent avec le mercure, un polluant industriel, ce qui nécessitait une compréhension de TOUTE les organismes dans un environnement donné, et pas seulement la petite partie qui pourrait être cultivée avec succès dans des boîtes de Pétri en laboratoire. Mais la question sous-jacente était si fondamentale qu’elle reste l’une des questions fondamentales qui animent la biologie. Comme Barkay, qui est maintenant à la retraite, l’a dit dans une récente interview depuis Boulder, Colorado : « Qui est là ? Et, tout aussi important, elle a ajouté : « Que font-ils là ?

De telles questions sont toujours d’actualité aujourd’hui, posées par les écologistes, les responsables de la santé publique, les biologistes de la conservation, les médecins légistes et ceux qui étudient l’évolution et les environnements anciens – et elles poussent les épidémiologistes et les biologistes en cuir de chaussures vers les coins les plus reculés du monde.

La solution 1987 papier Barkay et ses collègues ont publié dans le Journal des méthodes microbiologiques a décrit une méthode-« Extraction directe de l'ADN environnemental » : cela permettrait aux chercheurs de procéder à un recensement. C’était un outil pratique, quoique plutôt compliqué, pour détecter qui se trouvait là-bas. Barkay l'a utilisé pour le reste de sa carrière.

Aujourd’hui, l’étude est citée comme un premier aperçu de l’ADNe, ou ADN environnemental, un moyen relativement peu coûteux, répandu et potentiellement automatisé d’observer la diversité et la répartition de la vie. Contrairement aux techniques précédentes, qui permettaient d'identifier l'ADN d'un seul organisme, par exemple, la méthode collecte également le nuage tourbillonnant d'autres matériaux génétiques qui l'entourent. Ces dernières années, le domaine s’est considérablement développé. "Il a son propre journal", a déclaré Eske Willerslev, généticienne évolutionniste à l'Université de Copenhague. « Elle a sa propre société, une société scientifique. C’est devenu un domaine établi.

« Nous sommes tous floconneux, n'est-ce pas ? Il y a des morceaux de débris cellulaires qui se détachent tout le temps.

L’eDNA sert d’outil de surveillance, offrant aux chercheurs un moyen de détecter ce qui semble indétectable. En échantillonnant l'ADNe, ou des mélanges de matériel génétique, c'est-à-dire des fragments d'ADN, le modèle de la vie, dans l'eau, le sol, les carottes de glace, les cotons-tiges ou pratiquement n'importe quel environnement imaginable, même l'air pur, il est désormais possible de rechercher un organisme spécifique ou assembler un instantané de tous les organismes dans un endroit donné. Au lieu d’installer une caméra pour voir qui traverse la plage la nuit, l’eDNA extrait ces informations des empreintes de pas dans le sable. "Nous sommes tous floconneux, n'est-ce pas ?" a déclaré Robert Hanner, biologiste à l'Université de Guelph au Canada. "Il y a des morceaux de débris cellulaires qui se détachent tout le temps."

En tant que méthode permettant de confirmer la présence de quelque chose, l’ADNe n’est pas infaillible. Par exemple, l’organisme détecté dans l’ADNe pourrait ne pas vivre réellement à l’endroit où l’échantillon a été collecté ; Hanner a donné l'exemple d'un oiseau de passage, un héron, qui a mangé une salamandre et a ensuite fait caca une partie de son ADN, ce qui pourrait être l'une des raisons pour lesquelles les signaux de l'amphibien sont présents dans certaines zones où ils n'ont jamais été physiquement trouvés.

Pourtant, l’ADNe a la capacité d’aider à détecter les traces génétiques, dont certaines se détachent dans l’environnement, offrant ainsi un moyen passionnant – et potentiellement effrayant – de collecter des informations sur les organismes, y compris les humains, dans le cadre de leurs activités quotidiennes.

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Le conceptuel La base de l’ADNe – prononcé EE-DEE-EN-AY et non ED-NUH – remonte à cent ans, avant l’avènement de la biologie dite moléculaire, et elle est souvent attribuée à Edmond Locard, un criminologue français travaillant au début 20ième siècle. Dans une série de papiers publié en 1929, Locard propose un principe : tout contact laisse une trace. Essentiellement, l’eDNA amène le principe de Locard au 21e siècle.

Pendant les premières décennies, le domaine qui est devenu l’ADNe – y compris les travaux de Barkay dans les années 1980 – s’est largement concentré sur la vie microbienne. En regardant son évolution, l’ADNe semble avoir mis du temps à sortir de la boue proverbiale.

Ce n'est qu'en 2003 que la méthode s'est avérée écosystème disparu. Dirigée par Willerslev, l'étude de 2003 a extrait l'ADN ancien de moins d'une cuillère à café de sédiments, démontrant pour la première fois la faisabilité de détecter des organismes plus gros avec cette technique, notamment des plantes et des mammouths laineux. Dans la même étude, des sédiments collectés dans une grotte néo-zélandaise (qui n'avaient notamment pas été gelés) révélaient un oiseau disparu : le moa. Ce qui est peut-être le plus remarquable, c’est que ces applications pour l’étude de l’ADN ancien découlent d’une quantité prodigieuse d’excréments déposés sur le sol il y a des centaines de milliers d’années.

Willerslev avait eu l'idée pour la première fois quelques années plus tôt en réfléchissant à un tas de crottes plus récent : entre sa maîtrise et son doctorat. À Copenhague, il s'est retrouvé désemparé, luttant pour obtenir des os, des restes squelettiques ou d'autres spécimens physiques à étudier. Mais un automne, il a regardé par la fenêtre « un chien qui faisait ses besoins dans la rue », se souvient-il. La scène l’a amené à réfléchir à l’ADN présent dans les excréments et à la façon dont il a été emporté par la pluie, ne laissant aucune trace visible. Mais Willerslev s'est demandé : « Se pourrait-il que l'ADN puisse survivre ? » C’est ce que j’ai ensuite tenté de découvrir.

L'article démontre la remarquable persistance de l'ADN, qui, selon lui, survit dans l'environnement beaucoup plus longtemps que ne le suggéraient les estimations précédentes. Willerslev a depuis analysé l'ADNe dans la toundra gelée du Groenland moderne, remontant à 2 millions d'années, et il travaille sur des échantillons d'Angkor Wat, l'énorme complexe de temples du Cambodge qui aurait été construit au XIIe siècle. "Cela devrait être la pire préservation de l'ADN que vous puissiez imaginer", a-t-il déclaré. "Je veux dire, il fait chaud et humide."

Mais, a-t-il ajouté, "nous pouvons extraire l'ADN".

L’ADNe a la capacité d’aider à rechercher des traces génétiques, offrant ainsi un moyen passionnant – et potentiellement effrayant – de collecter des informations sur les organismes dans le cadre de leurs activités quotidiennes.

Willerslev n’est désormais pas le seul à entrevoir un outil potentiel aux applications apparemment illimitées, surtout maintenant que les progrès permettent aux chercheurs de séquencer et d’analyser de plus grandes quantités d’informations génétiques. "C'est une fenêtre ouverte sur beaucoup, beaucoup de choses", a-t-il déclaré, "et bien plus que ce à quoi je peux penser, j'en suis sûr." Il ne s’agissait pas seulement d’anciens mammouths ; L’ADNe pourrait révéler les organismes actuels qui se cachent parmi nous.

Les scientifiques utilisent l'ADNe pour suivre des créatures de toutes formes et de toutes tailles, qu'il s'agisse d'une seule espèce, comme de minuscules morceaux d'algues envahissantes, des anguilles du Loch Ness ou une taupe aveugle vivant dans le sable qui n'a pas été vue depuis près de 90 ans ? les chercheurs échantillonnent des communautés entières, par exemple en examinant l’ADNe trouvé sur les fleurs sauvages ou l’ADNe soufflé par le vent comme indicateur de tous les oiseaux, abeilles et autres pollinisateurs animaux en visite.

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La prochaine Un bond en avant évolutif dans l'histoire de l'ADNe a pris forme autour de la recherche d'organismes vivant actuellement dans les environnements aquatiques de la Terre. En 2008, un le titre est apparu: "L'eau conserve la mémoire ADN des espèces cachées." Cela ne vient pas du tabloïd des supermarchés, mais de la publication spécialisée réputée Chemistry World, décrivant les travaux du chercheur français Pierre Taberlet et de ses collègues. Le groupe a recherché des ouaouarons bruns et verts, qui peuvent peser plus de 2 livres et, parce qu'ils fauchent tout sur leur passage, sont considérés comme une espèce envahissante en Europe occidentale. La recherche des ouaouarons impliquait généralement des herpétologues qualifiés qui scrutaient les rivages avec des jumelles, puis revenaient après le coucher du soleil pour écouter leurs cris. Le papier 2008 a suggéré un moyen plus simple : une enquête qui nécessitait beaucoup moins de personnel.

"Vous pourriez extraire l'ADN de cette espèce directement de l'eau", a déclaré Philip Thomsen, biologiste à l'Université d'Aarhus (qui n'a pas participé à l'étude). "Et cela a vraiment lancé le domaine de l'ADN environnemental."

Les grenouilles peuvent être difficiles à détecter et elles ne sont bien sûr pas la seule espèce qui échappe à la détection plus traditionnelle sur le terrain. Thomsen a commencé à travailler sur un autre organisme qui confond notoirement les mesures : poissons. On dit parfois que compter les poissons ressemble vaguement à compter les arbres, sauf qu'ils se déplacent librement, dans des endroits sombres, et que les compteurs de poissons font leur décompte les yeux bandés. L’ADN environnemental a laissé tomber le bandeau. Un Avis de la littérature publiée sur la technologie – même si elle comportait des mises en garde, notamment des détections imparfaites et imprécises ou des détails sur l’abondance – a révélé que les études sur l’ADNe des poissons et amphibiens d’eau douce et marins étaient plus nombreuses que leurs homologues terrestres 7 : 1.

En 2011, Thomsen, alors titulaire d'un doctorat. candidat dans le laboratoire de Willerslev, a publié un papier démontrant que la méthode pouvait détecter rare et les espèces menacées, telles que celles peu abondantes en Europe, notamment les amphibiens, les mammifères comme la loutre, les crustacés et les libellules. "Nous avons montré qu'un simple verre d'eau suffisait vraiment à détecter ces organismes", a-t-il déclaré. Undark. C’était clair : la méthode avait des applications directes en biologie de la conservation pour la détection et la surveillance des espèces.

En 2012, la revue Molecular Ecology a publié un numéro spécial sur l'eDNA, et Taberlet et plusieurs collègues ont présenté une définition pratique de l'ADNe comme tout ADN isolé d'échantillons environnementaux. La méthode décrit deux approches similaires mais légèrement différentes : On peut répondre par oui ou par non à une question : le ouaouaron (ou autre) est-il présent ou non ? Pour ce faire, il scanne le code-barres métaphorique, de courtes séquences d'ADN particulières à une espèce ou une famille, appelées amorces ; le scanner de caisse est une technique courante appelée réaction en chaîne par polymérase quantitative en temps réel, ou qPCR.

Les scientifiques utilisent l'ADNe pour suivre des créatures de toutes formes et de toutes tailles, qu'il s'agisse de minuscules morceaux d'algues envahissantes, d'anguilles du Loch Ness ou d'une taupe aveugle vivant dans le sable qui n'a pas été vue depuis près de 90 ans.

Une autre approche, communément connue sous le nom de métabarcodage ADN, génère essentiellement une liste d’organismes présents dans un échantillon donné. « Vous posez en quelque sorte la question : qu’est-ce qu’il y a ici ? » dit Thomsen. « Et puis vous obtenez toutes les choses connues, mais vous avez aussi des surprises, n'est-ce pas ? Parce qu’il y avait certaines espèces dont vous ignoriez l’existence réelle.

L'un vise à trouver l'aiguille dans une botte de foin ; l'autre tente de révéler toute la botte de foin. L’ADNe diffère des techniques d’échantillonnage plus traditionnelles où les organismes, comme les poissons, sont capturés, manipulés, stressés et parfois tués. Les données obtenues sont objectives ; c'est standardisé et impartial.

"L'ADNe, d'une manière ou d'une autre, va rester l'une des méthodologies importantes en sciences biologiques", a déclaré Mehrdad Hajibabaei, biologiste moléculaire à l'Université de Guelph, pionnier de l'approche des métabarcodes et qui tracée pêchez à quelque 9,800 XNUMX pieds sous la mer du Labrador. «Chaque jour, je vois bouillonner quelque chose qui ne m'était pas venu à l'esprit.»

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Ces dernières années, le domaine de l’eDNA s’est élargi. La sensibilité de la méthode permet aux chercheurs d'échantillonner des environnements auparavant hors de portée, par exemple en capturant l'ADNe depuis les airs, une approche qui met en évidence les promesses de l'ADNe et ses pièges potentiels. L’ADNe aéroporté semble circuler sur une ceinture de poussière mondiale, ce qui suggère son abondance et son omniprésence, et il peut être filtré et analysé pour surveiller les plantes et les animaux terrestres. Mais l’ADNe soufflé par le vent peut entraîner une contamination par inadvertance.

En 2019, Thomsen, par exemple, j'ai laissé deux bouteilles d'eau ultra pure à l'air libre, l'un dans une prairie et l'autre près d'un port maritime. Après quelques heures, l'eau contenait de l'ADNe détectable associé aux oiseaux et au hareng, ce qui suggère que des traces d'espèces non terrestres se sont déposées dans les échantillons ; les organismes n’habitaient évidemment pas les bouteilles. "Cela doit donc venir des airs", a déclaré Thomsen à Undark. Les résultats suggèrent un double problème : d'une part, les traces peuvent se déplacer, où deux organismes qui entrent en contact peuvent alors se déplacer autour de l'ADN de l'autre, et ce n'est pas parce qu'un certain ADN est présent que l'espèce est réellement là. .

De plus, rien ne garantit que la présence d'ADNe indique qu'une espèce est vivante, et des enquêtes sur le terrain sont toujours nécessaires, a-t-il déclaré, pour comprendre le succès de reproduction d'une espèce, sa santé ou l'état de son habitat. Jusqu’à présent, l’ADNe ne remplace donc pas nécessairement les observations ou collections physiques. Dans une autre étude, dans laquelle le groupe de Thomsen a collecté ADNe sur les fleurs pour rechercher des oiseaux pollinisateurs, plus de la moitié de l'ADNe rapporté dans le document provenait d'humains, une contamination qui a potentiellement brouillé les résultats et rendu plus difficile la détection des pollinisateurs en question.

De même, en mai 2023, une équipe de l’Université de Floride qui avait déjà étudié les tortues marines grâce aux traces d’ADNe laissées lorsqu’elles rampent le long de la plage. publié un article qui a révélé l'ADN humain. Les échantillons étaient suffisamment intacts pour détecter des mutations clés qui pourraient un jour être utilisées pour identifier des individus, ce qui suggère que la surveillance biologique a également soulevé des questions sans réponse sur les tests éthiques sur les humains et le consentement éclairé. Si l’ADNe servait de senne, alors il balayait sans discernement les informations sur la biodiversité et aboutissait inévitablement, comme le dit l’article de l’équipe de l’UF, à des « prises accessoires génétiques humaines ».

Alors que les problèmes de confidentialité liés aux empreintes de pas dans le sable semblent jusqu’à présent exister principalement dans le domaine hypothétique, l’utilisation de l’ADNe dans les litiges juridiques liés à la faune sauvage est non seulement possible mais déjà une réalité. Il est également utilisé dans les enquêtes criminelles : en 2021, par exemple, un groupe de chercheurs chinois rapporté que l'ADNe collecté sur le pantalon d'un meurtrier présumé avait, contrairement à ses affirmations, révélé qu'il s'était probablement rendu dans le canal boueux où un cadavre avait été retrouvé.

Les inquiétudes concernant l’ADNe hors cible, en termes d’exactitude et de portée en médecine humaine et en médecine légale, mettent en évidence une autre lacune, beaucoup plus large. Comme Hanner de l’Université de Guelph a décrit le problème : « Nos cadres réglementaires et nos politiques ont tendance à être en retard d’au moins une décennie par rapport à la science. »

«Chaque jour, je vois bouillonner quelque chose qui ne m'était pas venu à l'esprit.»

Aujourd'hui, il existe d'innombrables applications réglementaires potentielles pour la surveillance de la qualité de l'eau, l'évaluation de l'impact environnemental (y compris les parcs éoliens offshore et le forage pétrolier et gazier jusqu'au développement plus banal de centres commerciaux), la gestion des espèces et l'application de la loi sur les espèces en voie de disparition. Dans un affaire civile déposé en 2021, le US Fish and Wildlife Service a évalué si un poisson en péril existait dans un bassin versant particulier, en utilisant l'ADNe et un échantillonnage plus traditionnel, et a constaté que ce n'était pas le cas. Les tribunaux ont déclaré que le manque de protection de l'agence pour ce bassin versant était justifié. La question ne semble pas être de savoir si l’eDNA a résisté devant les tribunaux ; ça faisait. "Mais on ne peut vraiment pas dire que quelque chose n'existe pas dans un environnement", a déclaré Hajibabaei.

Il a récemment mis en évidence la question de la validation : l’ADNe déduit un résultat, mais nécessite des critères plus établis pour confirmer que ces résultats sont réellement vrais (qu’un organisme est réellement présent ou absent, ou en une certaine quantité). UN série de réunions spéciales car les scientifiques ont travaillé pour résoudre ces problèmes de normalisation, qui, selon lui, incluent les protocoles, la chaîne de contrôle et les critères de génération et d'analyse des données. Dans un Avis Dans le cadre des études sur l'ADNe, Hajibabaei et ses collègues ont constaté que le domaine est saturé d'études ponctuelles ou de validation de principe tentant de montrer que les analyses d'ADNe fonctionnent. La recherche reste extrêmement cloisonnée dans le monde universitaire.

Ainsi, les praticiens souhaitant utiliser l’ADNe dans des contextes appliqués demandent parfois la lune. L’espèce existe-t-elle à certains endroits ? Par exemple, a déclaré Hajibabaei, quelqu'un lui a récemment demandé s'il pouvait totalement réfuter la présence d'un parasite, prouvant qu'il n'était pas apparu dans une ferme aquacole. «Et je dis: 'Écoutez, je ne peux pas dire que c'est à 100 pour cent.'»

Même avec un cadre analytique rigoureux, a-t-il déclaré, les problèmes de faux négatifs et de faux positifs sont particulièrement difficiles à résoudre sans faire l’une des choses que l’eDNA évite : une collecte plus traditionnelle et une inspection manuelle. Malgré les limites, une poignée d’entreprises commencent déjà à commercialiser cette technique. Par exemple, de futures applications pourraient aider une entreprise à confirmer si le pont qu’elle construit nuira à des animaux localement menacés ? une entreprise d'aquaculture détermine-t-elle si les eaux où elle élève ses poissons sont infestées de poux du poisson ? ou un propriétaire foncier curieux de savoir si les nouvelles plantations attirent un plus large éventail d’abeilles indigènes.

Le problème est plutôt fondamental étant donné la réputation de l’eDNA comme moyen indirect de détecter l’indétectable – ou comme solution de contournement dans des contextes où il n’est tout simplement pas possible de plonger un filet et d’attraper tous les organismes présents dans la mer.

« Il est très difficile de valider certains de ces scénarios », a déclaré Hajibabaei. "Et c'est fondamentalement la nature de la bête."

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ADNe ouvre beaucoup de possibilités, répondant à une question initialement posée par Barkay (et sans doute bien d’autres) : « Qui est là ? Mais de plus en plus, il fournit des indices qui amènent à se demander « Que font-ils là ? » question aussi. Elizabeth Clare, professeure de biologie à l'Université York à Toronto, étudie la biodiversité. Elle a déclaré avoir observé des chauves-souris se percher au même endroit pendant la journée, mais, en collectant de l'ADNe en suspension dans l'air, elle pourrait également déduire où les chauves-souris socialisent la nuit. En autre étude, l'ADNe d'un chien domestique a été retrouvé dans des excréments de renard roux. Les deux canidés ne semblaient pas se croiser, mais les chercheurs se sont demandés si leur proximité avait conduit à une confusion ou à une contamination croisée, avant de finalement se prononcer sur une autre explication : les renards mangeaient apparemment des crottes de chien.

Ainsi, bien que l'ADNe ne révèle pas intrinsèquement le comportement animal, selon certains témoignages, ce domaine fait de grands progrès pour fournir des indices sur ce qu'un organisme pourrait faire et comment il interagit avec d'autres espèces dans un environnement donné - glanant des informations sur la santé sans observer directement. comportement.

Prenez une autre possibilité : la biosurveillance à grande échelle. En effet, au cours des trois dernières années, plus de personnes que jamais ont participé à une expérience audacieuse déjà opérationnelle : la collecte d’échantillons environnementaux dans les égouts publics pour traquer les particules virales du Covid-19 et d’autres organismes qui infectent les humains. Techniquement, l’échantillonnage des eaux usées implique une approche connexe appelée ARNe, car certains virus ne contiennent que des informations génétiques stockées sous forme d’ARN plutôt que d’ADN. Pourtant, les mêmes principes s’appliquent. (Des études suggèrent également que l'ARN, qui détermine les protéines qu'un organisme exprime, pourrait être utilisé pour évaluer la santé des écosystèmes ; les organismes en bonne santé peuvent exprimer des protéines totalement différentes de celles qui sont stressées.) En plus de surveiller la prévalence des maladies, les eaux usées La surveillance montre comment une infrastructure existante conçue pour faire une chose (les égouts ont été conçus pour collecter les déchets) pourrait être transformée en un outil puissant pour étudier autre chose, comme détecter des agents pathogènes.

Clare a l'habitude de faire exactement cela. « Personnellement, je fais partie de ces personnes qui ont tendance à utiliser les outils de manière inappropriée », a-t-elle déclaré. Clare faisait partie des chercheurs qui ont remarqué une lacune dans la recherche : il y avait beaucoup moins de travaux sur l'ADNe sur les organismes terrestres. Elle a donc commencé à travailler avec ce qu’on pourrait appeler un filtre naturel, c’est-à-dire des vers qui sucent le sang des mammifères. « Il est beaucoup plus facile de collecter 1,000 XNUMX sangsues que de retrouver les animaux. Mais ils contiennent des repas de sang et le sang transporte l’ADN des animaux avec lesquels ils ont interagi », a-t-elle déclaré. «C'est comme si vous aviez un groupe d'assistants de terrain qui effectuaient des relevés pour vous.» Puis, une de ses élèves a pensé la même chose pour les bousiers, qui sont encore plus faciles à collecter.

Clare est désormais à la tête d'une nouvelle application pour un autre système de surveillance continue, exploitant les moniteurs de qualité de l'air existants qui mesurent les polluants, tels que les particules fines, tout en aspirant simultanément l'ADNe du ciel. Fin 2023, elle ne disposait que d’un petit ensemble d’échantillons, mais avait déjà découvert que, en tant que sous-produit de la surveillance de routine de la qualité de l’air, ces outils préexistants faisaient également office de filtres pour le matériau qu’elle recherchait. Il s’agissait plus ou moins d’un réseau transcontinental réglementé collectant des échantillons de manière très cohérente sur de longues périodes de temps. "Vous pourriez ensuite l'utiliser pour créer des séries chronologiques et des données à haute résolution sur des continents entiers", a-t-elle déclaré.

Rien qu'au Royaume-Uni, a déclaré Clare, il existe environ 150 sites différents. aspirer une quantité connue d'air, chaque semaine, toute l'année, ce qui représente environ 8,000 17 mesures par an. Clare et ses co-auteurs ont récemment analysé un petit sous-ensemble de ces mesures (180 mesures provenant de deux endroits) et ont pu identifier plus de 80 groupes taxonomiques différents, plus de 26 types différents de plantes et de champignons, 34 espèces différentes de mammifères, 35 différentes espèces d'oiseaux, ainsi qu'au moins XNUMX espèces d'insectes.

Certes, d’autres chantiers de recherche écologique à long terme existent. Les États-Unis disposent d’un réseau de telles installations. Mais leur champ d’étude n’inclut pas une infrastructure distribuée à l’échelle mondiale qui mesure en permanence la biodiversité, y compris le passage des oiseaux migrateurs jusqu’à l’expansion et la contraction des espèces avec le changement climatique. On peut soutenir que l’eDNA complétera probablement, plutôt que de supplanter, le réseau distribué de personnes qui enregistrent des observations tempo-spatiales en temps réel, à haute résolution, sur des sites Web tels que eBird ou iNaturalist. Comme une image floue d’une toute nouvelle galaxie apparaissant, la résolution actuelle reste faible.

« Il s'agit d'une sorte de système de collecte généralisé, ce qui est quasiment inconnu dans le domaine de la science de la biodiversité », a déclaré Clare. Elle faisait référence à la capacité d’extraire des signaux eDNA de nulle part, mais le sentiment concernait la méthode dans son ensemble : « Ce n’est pas parfait », a-t-elle dit, « mais il n’y a rien d’autre qui fasse vraiment cela. »

Cet article a été publié initialement le Undark. Lis le article original. L’ADN environnemental est partout. Les scientifiques rassemblent tout. Intelligence des données PlatoBlockchain. Recherche verticale. Aï.