Grafik Konferensi SC23, yang diadakan awal bulan ini, memecahkan rekor penonton sebelumnya dengan lebih dari 14,000 peserta berangkat ke Denver, CO, untuk mengetahui pencapaian terbaru dalam komputasi kinerja tinggi (HPC). Seperti tahun-tahun sebelumnya, konferensi ini menyelenggarakan berbagai ceramah yang memungkinkan para ilmuwan mendiskusikan bagaimana superkomputer berdampak positif pada bidang mereka.
Karena HPC sangat berharga bagi hampir semua domain ilmiah, studi biologi terwakili dengan baik di SC23. Salah satu kajian yang menarik perhatian adalah ceramah yang disampaikan oleh Sayan Roychowdhury berdasarkan makalah penelitian “Peningkatan Simulasi Penyempurnaan Fisika Adaptif melalui Penambahan Jumlah Sel Darah Merah yang Realistis. "
Makalah ini, yang sebagian besar ditulis oleh ilmuwan Duke University bersama dengan peneliti dari Oak Ridge National Laboratory dan Lawrence Livermore National Laboratory, berfokus pada simulasi transportasi sel kanker melalui sistem peredaran darah bagian atas. Masalah utamanya, jelas Roychowdhury, adalah seberapa jauh perjalanan sel kanker dibandingkan dengan seberapa kecil ukurannya.
“[Kanker] membajak sistem yang menghubungkan seluruh tubuh – sistem peredaran darah,” kata Roychowdhury kepada para delegasi dalam pidatonya presentasi SC23. “Sel kanker ini berukuran mikron, mungkin puluhan mikron. Namun, jarak yang harus mereka tempuh diukur dalam meter. Kami sedang mengamati transportasi sel kanker dalam jarak jauh.”
Mengandalkan arsitektur hybrid CPU–GPU (central processoring unit–graphics processoring unit) pada Superkomputer puncak – termasuk 1500 GPU dan 10,800 CPU – tim dapat memperluasnya penyempurnaan fisika adaptif (APR) metode untuk melacak sel kanker individu saat bergerak melalui aliran darah.
Resolusi berbeda untuk hasil berbeda
Di antara banyak kekhawatiran terkait kanker, salah satu masalah utamanya adalah bagaimana sel kanker dapat bermetastasis dan menyebar ke seluruh tubuh. Seperti yang diungkapkan para peneliti dalam makalah mereka, metastasis adalah penyebab lebih dari 90% kematian terkait kanker.
Untuk memahami proses ini lebih lanjut, para peneliti menerapkan metode APR untuk menggabungkan wilayah sel darah merah yang diselesaikan secara halus dengan domain cairan curah yang diselesaikan secara kasar. Intinya, mereka mengambil grid yang mewakili model sel darah merah beresolusi tinggi dan memindahkannya melalui simulasi versi resolusi rendah dari pembuluh darah tubuh bagian atas. Sifat hibrid dari arsitektur komputasi penting di sini, karena CPU digunakan untuk area sekitar yang diselesaikan secara kasar sementara GPU berfokus pada grid yang diselesaikan secara halus.
Kotak ini berisi sel kanker, bersama dengan model sel darah merah beresolusi tinggi yang mengelilinginya saat bergerak melalui sistem peredaran darah. Saat sel kanker bergerak, jaringannya juga ikut bergerak. Pendekatan ini memastikan bahwa area di sekitar sel kanker kecil dimodelkan sehalus mungkin tanpa membuang sumber daya komputasi pada area di sistem peredaran darah yang tidak berada tepat di sekitar sel kanker.
Ada banyak aspek penting lainnya dari penelitian ini, termasuk deformasi akurat sel darah merah saat mengalir melalui sistem peredaran darah, serta batas antara kisi-kisi yang diselesaikan dengan halus dan area yang diselesaikan secara kasar di luar bingkai.
Fisika materi lunak membantu mengungkap apakah kanker kemungkinan besar akan menyebar
Salah satu poin terpenting dari penelitian ini, kata Roychowdhury, adalah bahwa metode APR yang canggih dapat mensimulasikan transpor sel kanker menggunakan sebagian kecil dari daya komputasi yang diperlukan untuk menjalankan model yang diselesaikan sepenuhnya. “Simulasi seperti ini yang seharusnya memakan ribuan node, bisa diperkecil menjadi hanya satu,” ujarnya. “Tujuan kami adalah membuat simulasi HPC ini dapat diakses oleh para ilmuwan.”
Ada pekerjaan di masa depan yang harus diselesaikan. Penelitian tim saat ini hanya berfokus pada satu sel kanker, sedangkan sel-sel ini umumnya terpecah dalam kelompok, bukan secara tunggal. Menanggapi pertanyaan dari audiens, Roychowdhury menyatakan bahwa tim juga tertarik untuk melakukan penelitian lebih lanjut di bidang ini mengenai sel sabit.
- Konten Bertenaga SEO & Distribusi PR. Dapatkan Amplifikasi Hari Ini.
- PlatoData.Jaringan Vertikal Generatif Ai. Berdayakan Diri Anda. Akses Di Sini.
- PlatoAiStream. Intelijen Web3. Pengetahuan Diperkuat. Akses Di Sini.
- PlatoESG. Karbon, teknologi bersih, energi, Lingkungan Hidup, Tenaga surya, Penanganan limbah. Akses Di Sini.
- PlatoHealth. Kecerdasan Uji Coba Biotek dan Klinis. Akses Di Sini.
- Sumber: https://physicsworld.com/a/modelling-a-single-cancer-cell-in-a-sea-of-blood/
- :adalah
- :bukan
- 000
- 10
- 14
- 160
- 425
- a
- Sanggup
- Tentang Kami
- dapat diakses
- Akun
- tepat
- prestasi
- ACM
- adaptif
- tambahan
- maju
- diizinkan
- sepanjang
- juga
- an
- dan
- terapan
- pendekatan
- April
- arsitektur
- ADALAH
- DAERAH
- daerah
- artistik
- AS
- aspek
- At
- peserta
- para penonton
- Authored
- berdasarkan
- BE
- antara
- darah
- tubuh
- batas
- Istirahat
- Broke
- by
- CAN
- Kanker
- Sel kanker
- Menyebabkan
- Sel
- pusat
- Klik
- CO
- menggabungkan
- datang
- dibandingkan
- komputasi
- kekuatan komputasi
- menghitung
- komputasi
- tentang
- Kekhawatiran
- Konferensi
- menghubungkan
- berisi
- menciptakan
- terbaru
- delegasi
- Denver
- terperinci
- berbeda
- membahas
- jarak
- domain
- dilakukan
- turun
- Duke
- universitas adipati
- Terdahulu
- memastikan
- Seluruh
- esensi
- Setiap
- menjelaskan
- memperpanjang
- jauh
- Fields
- Menemukan
- aliran
- cairan
- terfokus
- berfokus
- Untuk
- pecahan
- dari
- sepenuhnya
- lebih lanjut
- masa depan
- umumnya
- tujuan
- GPU
- kisi
- he
- Kepala
- Dimiliki
- membantu
- di sini
- kinerja tinggi
- resolusi tinggi
- -nya
- host
- Seterpercayaapakah Olymp Trade? Kesimpulan
- Namun
- HPC
- HTTPS
- Hibrida
- IEEE
- gambar
- Segera
- segera
- dampak
- penting
- in
- Termasuk
- sendiri-sendiri
- informasi
- interaksi
- bunga
- tertarik
- tak ternilai
- isu
- IT
- jackson
- jpg
- hanya
- laboratorium
- Terbaru
- lawrence
- bacaan
- kuliah
- 'like'
- Mungkin
- Panjang
- mencari
- Utama
- utama
- membuat
- banyak
- max-width
- mungkin
- metode
- jutaan
- model
- pemodelan
- Bulan
- paling
- kebanyakan
- terharu
- bergerak
- nasional
- Alam
- Perlu
- node
- terkenal
- ek
- Laboratorium Nasional Oak Ridge
- of
- lepas
- on
- ONE
- hanya
- Buka
- urutan
- ORNL
- Lainnya
- di luar
- di luar
- lebih
- kertas
- tertentu
- Fisika
- Dunia Fisika
- plato
- Kecerdasan Data Plato
- Data Plato
- Titik
- poin
- positif
- mungkin
- kekuasaan
- disajikan
- hadiah
- sebelumnya
- proses
- pengolahan
- pertanyaan
- agak
- realistis
- arsip
- Merah
- wilayah
- diwakili
- wajib
- penelitian
- peneliti
- diselesaikan
- Sumber
- menanggapi
- mengungkapkan
- Run
- Tersebut
- ilmiah
- ilmuwan
- SEA
- tampaknya
- harus
- penting
- simulasi
- tunggal
- kecil
- penyebaran
- menyatakan
- aliran
- studi
- Belajar
- Superkomputer
- Sekitarnya
- sistem
- Mengambil
- tim
- memiliki
- dari
- bahwa
- Grafik
- Daerah
- mereka
- Ini
- mereka
- ini
- ribuan
- Melalui
- di seluruh
- kuku ibu jari
- untuk
- mengatakan
- mengambil
- jalur
- Pelacakan
- mengangkut
- perjalanan
- benar
- pokok
- memahami
- satuan
- universitas
- menggunakan
- bekas
- menggunakan
- variasi
- versi
- vital
- adalah
- BAIK
- adalah
- ketika
- apakah
- sementara
- dengan
- tanpa
- Kerja
- dunia
- tahun
- zephyrnet.dll