Yeni bir çalışmada, Okinawa Bilim ve Teknoloji Enstitüsü'nden (OIST) bilim insanları, aralarında K. MIKIMOTO & CO., LTＤ, Pearl Araştırma Enstitüsü ve Japonya Balıkçılık Araştırma ve Eğitim Ajansı'nın da bulunduğu diğer birçok araştırma enstitüsüyle işbirliği içinde, yeni bir araştırma gerçekleştirdi. inci istiridyesinin neredeyse tamamlanmış, haplotip aşamalı genom düzeneğini bildirdi. İnci istiridyelerinin bu yüksek kaliteli, kromozom ölçekli genomu, dirençli türlerin bulunmasında kullanılabilir.
Genom dizilimi için geleneksel yöntem, kromozom çiftinin birleştirilmesini içerir. Ancak bu durum normalde iki hayvan çifti arasında neredeyse aynı genetik bilgiye sahip olan laboratuvar hayvanları için iyi gidiyor. kromozomlar. Ancak kromozom çiftleri arasında çok sayıda gen varyasyonunun bulunduğu vahşi hayvanlar için bu strateji, bilgi kaybıyla sonuçlanır.
Bu araştırma için genomları sıralarken bilim insanları kromozomları birleştirmemeye karar verdi. Bunun yerine her iki kromozom seti de sıralandı. Bu, deniz omurgasızlarına odaklanan ve bu yöntemi kullanan ilk araştırmadır.
İnci istiridyelerinde 28 çift olduğundan toplam 14 kromozom bulunur. Bilim insanları daha sonra ileri teknolojiyi kullanarak genom dizilimi. Daha sonra 28 kromozomun tamamını yeniden yapılandırdılar ve bir çiftin ikisi (9. kromozom çifti) arasında önemli farklar buldular. Özellikle bu genlerin çoğunun bağışıklıkla ilişkili olduğu görüldü.
OIST'in Deniz Genomik Birimi'nde çalışan bilim adamı Dr. Takeshi Takeuchi şunları söyledi: "Bir çift kromozom üzerindeki farklı genler önemli bir bulgu çünkü proteinler farklı türdeki bulaşıcı hastalıkları tanıyabiliyor."
"Hayvan kültüre alındığında genellikle hayatta kalma oranı daha yüksek olan bir tür ortaya çıkar veya daha güzel inciler üretir. Çiftçiler sıklıkla bu türe sahip iki hayvan yetiştiriyor, bu da akraba çiftliğine yol açıyor ve genetik çeşitliliği azaltıyor."
Ardışık üç akrabalı yetiştirme döngüsünden sonra, bilim adamları genetik çeşitlilikte önemli bir azalma buldular. Bu azalmış çeşitlilik, bağışıklıkla ilgili genlerin bulunduğu kromozom bölgelerinde meydana gelirse, hayvanın bağışıklığını etkileyebilir.
"Su ürünleri yetiştiriciliği popülasyonlarında genom çeşitliliğini korumak önemlidir."
Prof. Shugo Watabe (Kitasato Üniversitesi'nde Misafir Profesör, Tokyo Üniversitesi'nde fahri profesör) şuraya, “Kültür incileri dünyada ilk kez 130 yıl önce Japonya’da Kokichi Mikimoto tarafından geliştirildi. Bugün bile deniz tarağından sonra Japonya'da üretilen en çok ihraç edilen ikinci deniz ürünüdür. Ancak Japonya'da inci yetiştiriciliğinin tarihi, su ürünleri yetiştiriciliği ortamındaki hastalıklara karşı bir mücadele olmuştur. Özellikle 1996 yılında ortaya çıkan kırmızı renklenme hastalığının yarattığı hasar çok ağır oldu.”
"Japonya'da kültür incilerinin üretimi önemli ölçüde azaldı. Son yıllarda inci yetiştiriciliği sektörü, virüslerin neden olduğu hastalıkların yayılması nedeniyle bir kez daha büyük sorunlarla karşı karşıya kalıyor. Hastalıkların nedenleri ve karşı önlemlerin detayları henüz belirlenmemiş olsa da, Japonya'da inci yetiştiriciliğinin, üstün özelliklere sahip inci istiridyelerinin akraba yetiştirmesi nedeniyle genetik bozulmaya maruz kalabileceği, bunun da çeşitli hastalıklara yanıt vermeyi zorlaştırdığı belirtildi. çevresel değişiklikler ve ortaya çıkışı patojenler".
Bu çalışmanın sonuçları Japonya'da inci yetiştiriciliği konusunu açıklığa kavuşturmuş olup önemli endüstriyel çıkarımlara sahiptir. Birçok bağışıklık sistemiAyrıca genleri de belirlendi. Bu, inci istiridyelerinin dışarıdan içeri giren yabancı bir nesneye tepki olarak neden sedefli bir kaplama üretebildiğini açıklıyor ve bu da inci üretiminin kendisini çevreleyen gizeme ışık tutuyor.
Dergi Referans:
- Takeshi Takeuchi, Yoshihiko Suzuki, Shugo Watabe ve diğerleri. Yüksek kaliteli, haplotip aşamalı genom rekonstrüksiyonu, inci istiridyesindeki beklenmedik haplotip çeşitliliğini ortaya koyuyor DNA Araştırması. DOI: 10.1093/dnares/dsac035
