Aichi Kanser Merkezi ve NEC, Akciğer Kanseri Antijenlerini ve Antijene Spesifik T Hücrelerini Belirlemek İçin Etkili Bir Yöntem Geliştirdi

TOKYO, 08 Ağustos 2023 – (JCN Newswire) – Aichi Kanser Merkezi ve NEC Corporation'ın Gifu Üniversitesi, Toyama Üniversitesi ve Kitasato Üniversitesi Tıp Merkezi ile birlikte araştırma grubu, akciğer kanseri antijenlerini ve antijene özgü T hücrelerini verimli bir şekilde tanımlamak için bir yöntem geliştirdi antijenleri hem Tümör Sızan Lenfositlerin (TIL'ler) tek hücreli analizi hem de NEC'in bağışıklık tepkisini tahmin eden AI tabanlı antijen tahmin sistemi yoluyla tanıyan. Bu çalışmanın sonuçlarını anlatan yazımız 6 Ağustos 2023 tarihinde Society of Immunotherapy of Cancer'ın (SITC) Amerika Birleşik Devletleri'ndeki resmi dergisi olan “Journal for ImmunoTherapy of Cancer”da yayınlandı.

Şekil 1. Bu Çalışmanın Genel Planı

Şekil 2. Üç cerrahi akciğer tümörü dokusundan türetilen 6,998 TIL'in ekspresyon profillerinin tekdüze manifold yaklaşımı ve projeksiyonu (UMAP). TIL'ler 10 farklı kümeye ayrılır.

Şekil 3. Toplam beş tümör antijeni (KK-LC-1, mutant SORL1, mutant JAGN1, mutant AKT2, mutant ITGB5) ve dokuz tümör antijenine özgü TCR (farklı renklerle gösterilmiştir, toplamda 140 TCR klonu) tanımlandı.

Şekil 4. (A) Dokuz TCR ​​ifade eden TCR klonlarının (n=140) yeniden kümelenmesi. (B) Her antijende T hücresi alt kümesini tanımlayan genlerin ekspresyon analizi.

Araştırma Geçmişi

Akciğer kanseri, dünya çapında en yaygın kanserlerden biridir ve kansere bağlı ölümlerin önde gelen nedenlerinden biridir. Cerrahi, kemoterapi, radyasyon tedavisi, moleküler hedefli tedavi, immünoterapi ve bunların kombinasyonları gibi birçok kanser tedavisi türü vardır. Son zamanlarda geliştirilen immün kontrol noktası inhibitörleri (ICI) yeni bir tedavi olarak dikkatleri üzerine çekmiştir ve akciğer kanseri, ICI'ye en duyarlı kanserlerden biridir, ancak bireylerin yalnızca bir alt kümesinde etkilidir. Buna göre, akciğer kanseri için yeni etkili immünoterapilere ihtiyaç vardır.

TIL'deki sitotoksik T lenfositleri (CTL'ler), tümör hücrelerini spesifik olarak tanıyabilen ve yok edebilen çok önemli bağışıklık hücreleridir. CTL tarafından hedeflenen antijenler, hastaya özgü neoantijenleri ve kanser-testis antijenleri (CTA) gibi hastalar arasında yaygın olarak eksprese edilen yaygın antijenleri içerir. Genel olarak, herhangi bir antijeni tanımlamak kolay değildir. Bu antijenler etkili bir şekilde tanımlanabiliyorsa, ICI'ler ve antijene özgü immünoterapi ile bir kombinasyon tedavisi tedavinin etkinliğini artırabilir.

Bu araştırmanın içeriği ve sonuçları

Aichi Kanser Merkezi ve NEC tarafından yapılan bu çalışmada, cerrahi olarak rezeke edilmiş küçük hücreli dışı akciğer kanseri (KHDAK) hastalarının (n=3) TIL özelliklerini belirlemek için tek hücreli bir analiz gerçekleştirdik (Şekil 1). Daha sonra, TIL'leri gen ekspresyon profiline göre 10 kümeye ayırdık ve tükenme belirteçleri olarak adlandırılan genlerin ifadesi ile karakterize edilen tükenmiş T hücre kümesini (Tex kümesi) belirledik (Şekil 2). Tanımlanan tükenmiş T hücre kümesinde bulunan TCR'leri sentezledik ve TCR'lerin her birini karşılık gelen her T hücresine indükledik ve NEC'in AI tabanlı antijen tahmin sistemi ve tipik CTA'lar tarafından tahmin edilen neoantijenlere karşı bağışıklık tepkilerini inceledik. NEC'in AI tabanlı antijen tahmin sisteminin, bağışıklık tepkilerine neden olan antijenleri doğru bir şekilde tahmin edebildiği doğrulandı ve KK-LC-1'i tanıyan dört TCR (CTA'lardan biri, *2) ve neoantijenleri tanıyan beş TCR belirledik ( Figür 3).

araştırmacının yorumu

Dr. Hirokazu Matsushita, Aichi Kanser Merkezi, Çeviri Onkoimmünoloji Bölümü Şefi
Aichi Kanser Merkezi, NEC ve önde gelen araştırma enstitüleri ile işbirliği içinde, kanserli hastalardan alınan cerrahi numuneleri kullanarak antijenleri ve antijene özgü T hücrelerini verimli bir şekilde tanımlamak için bir prosedür geliştirdi. İleriye dönük olarak, kansere sızan T hücrelerinin doğasını daha da açıklığa kavuşturmak için bu sisteme antijenler ve antijene özgü T hücreleri içeren kanser mikro ortamının uzamsal bir analizini ekleyeceğiz. Bu çalışmalardan yenilikçi kanser immünoterapileri geliştirmeyi hedeflemenin yanı sıra, elde edilen bilgileri diğer kanserlere de uygulayacağız.

Yoshiko Yamashita, Ph.D. Kıdemli Uzman, AI İlaç Geliştirme Bölümü, NEC Corporation
NEC, neoantijenleri hedef alan kişiselleştirilmiş kanser aşısı tedavilerinin klinik denemelerini yürütüyor. Bu çalışmada oluşturulan antijene özgü T hücrelerini tanımlamaya yönelik bir yöntem ve bir Özenli Değişken Bilgi Darboğazı (AVIB) yöntemi (* 3) NEC tarafından yeni geliştirilen yapay zekayı kullanarak TCR'ler ve antijenler arasındaki etkileşimleri tahmin etmek. Hastalara etkili tedaviler sağlamak için araştırma ve geliştirmeyi hızlandırmaya devam edeceğiz.

Araştırma desteği
Aichi Kanser Merkezi Öncelikli Proje Araştırması
NEC Şirketi
Japonya Bilimi Teşvik Derneği'nin Bilimsel Araştırma Sübvansiyon Programı
Japonya Solunum Vakfı
Uehara Memorial Yaşam Bilimleri Vakfı

(1) Tek hücre analizi, bir doku kütlesinden ziyade her hücre için bir DNA transfer ürünü olan RNA'yı tespit edebilen ve seviyelerine göre tek tek hücrelerin bireyselliğini ve çeşitliliğini anlayabilen bir analiz yöntemidir. gen ifadesi.
(2) KK-LC-1 (KitaKyushu Lung Canner antijen-1): Kanserde ifade edildiği bildirilen kanser ve testis antijenleri.
(3) Özenli Değişken Bilgi Darboğazı (AVIB) Yöntemi: AI kullanarak TCR'ler ve antijenler arasındaki etkileşimleri tahmin etmek için NEC Avrupa Laboratuvarları ve NEC Laboratuvarları Amerika tarafından geliştirilen varyasyon bilgisi darboğaz yöntemi. (bit.ly/43YKys6)

NEC Corporation hakkında

NEC Corporation, "Daha parlak bir dünyayı yönetmek" marka beyanını desteklerken, BT ve ağ teknolojilerinin entegrasyonunda lider olarak kendini kanıtlamıştır. NEC, herkesin tam potansiyeline ulaşma şansına sahip olduğu daha sürdürülebilir bir dünyayı teşvik etmek için güvenlik, emniyet, adalet ve verimlilik gibi sosyal değerleri sağladığı için işletmelerin ve toplulukların hem toplumda hem de piyasada meydana gelen hızlı değişikliklere uyum sağlamasını sağlar. Daha fazla bilgi için www.nec.com adresinde NEC'i ziyaret edin.

• SEO Destekli İçerik ve Halkla İlişkiler Dağıtımı. Bugün Gücünüzü Artırın.
• PlatoData.Network Dikey Üretken Yapay Zeka. Kendine güç ver. Buradan Erişin.
• PlatoAiStream. Web3 Zekası. Bilgi Genişletildi. Buradan Erişin.
• PlatoESG. Otomotiv / EV'ler, karbon, temiz teknoloji, Enerji, Çevre, Güneş, Atık Yönetimi. Buradan Erişin.
• Blok Ofsetleri. Çevre Dengeleme Sahipliğini Modernleştirme. Buradan Erişin.
• Kaynak: https://www.jcnnewswire.com/pressrelease/85720/3/