ٹشو میں سیلولر فنکشن مقامی ماحول پر منحصر ہے. خلیات کی سالماتی خصوصیات کا نقشہ بنانا جب کہ ٹشو کے اندر ان کا صحیح مقام حاصل کرنا بیماری کی بہتر تفہیم کے لیے ضروری ہے۔
مقامی ٹرانسکرپٹومکس کے ظہور نے جینوم پیمانے پر جین ایکسپریشن میپنگ کو قابل بنایا ہے۔ پھر بھی، سیلولر سطح اور جینوم پیمانے پر ٹشو کی مقامی ایپی جینیٹک معلومات کو حاصل کرنے کی صلاحیت کا فقدان ہے۔ اب، کی ایک ٹیم ییل اور کیرولنسکا انسٹی ٹیوٹ کے محققین نے ٹشو سیکشنز کی مقامی طور پر حل شدہ کرومیٹن تک رسائی کی پروفائلنگ کے لیے ایک ٹیکنالوجی تیار کی ہے۔ یہ طریقہ مختلف ٹشوز میں انفرادی خلیات کے تفصیلی مالیکیولر ایٹلسز بنانے میں مدد کر سکتا ہے اور اس کا مقصد یہ سمجھنا ہے کہ بیماریاں کیسے نشوونما پاتی ہیں۔
طریقہ اس بات کی وضاحت کرتا ہے کہ کون سے علاقے کرومیٹن ایک ٹشو میں مخصوص جگہوں پر خلیوں میں جینوم تک رسائی کے قابل ہیں۔
جین ایکٹیویشن کے لیے اس کرومیٹن کی رسائی کی ضرورت ہوتی ہے، جو کسی خاص خلیے کی مالیکیولر حالت میں الگ بصیرت پیش کرتی ہے۔ خلیے کی شناخت، خلیے کی حالت، اور جین کے اظہار کو کنٹرول کرنے والے بنیادی میکانزم کو سمجھنے میں ایک اہم پیش رفت epigenetics - مختلف ٹشوز یا بیماریوں کی نشوونما میں خلیات کے مقامی مقام کے ساتھ کرومیٹن کی رسائی کے تجزیہ کو یکجا کرنے کی صلاحیت ہے۔
ییل میں بائیو میڈیکل انجینئرنگ کے پروفیسر رونگ فین نے کہا، "اب ہم کرومیٹن کی رسائی کی بنیاد پر ایک مقامی سیل اٹلس بنانے کے لیے سیل کی اقسام کی شناخت کر سکتے ہیں۔ ہم سیل کی حالتوں کی بہتر تعریف کے لیے یا سیل کی اقسام کو دریافت کرنے کے لیے ایپی جینیٹک سطح پر سیل کی اقسام کو براہ راست دیکھ سکتے ہیں۔
سائنسدانوں نے 'spatial-ATAC-seq' نامی طریقہ استعمال کرتے ہوئے ماؤس اور انسانی ٹشوز دونوں کو پروفائل کیا۔ دماغی بافتوں پر اس طریقہ کو استعمال کرنے سے سائنسدانوں کو یہ دیکھنے کی اجازت دی گئی کہ دماغ کے مختلف خطوں کی نشوونما کتنی پیچیدہ ہوتی ہے۔ مدافعتی خلیوں کی اقسام کی تنظیم کے بارے میں بصیرت حاصل کرنے کے لیے، انہوں نے اسے انسانی ٹنسل ٹشو پر بھی لگایا۔
پرستار نے کہا، "ہمیں ایک غیرجانبدار عالمی نقطہ نظر ملے گا، اور تمام ممکنہ سیل ریاستوں کے بارے میں ایک بہت بہتر ریزولوشن ویو، اور اس سے بھی اہم بات یہ کہ 'دیکھیں' کہ وہ ٹشو میں کہاں ہیں۔ یہ سیل کے نقشے اور سیل اٹلس بنانے کا ایک طاقتور ٹول ہے۔"
یانسیانگ ڈینگ، فین کی لیب میں پوسٹ ڈاکیٹرل ایسوسی ایٹ اور مطالعہ کے سرکردہ مصنف نے کہا کہ نیا طریقہ استعمال کرتے ہوئے، وہ اپنے آبائی مقام پر ماؤس کے دماغ کے ٹشو میں خلیوں کی اقسام کے ایپی جینوم کی شناخت کر سکتے ہیں۔
Goncalo Castelo-Branco، Karolinska Institutet میں glial سیل بیالوجی کے پروفیسر، نے کہا, "بیمار ٹشوز میں مقامی ATAC-Seq کا اطلاق مستقبل قریب میں ہمیں بیماری کے طاق کے تناظر میں مخصوص خلیات میں ایپی جینیٹک ریاستوں کے درمیان منتقلی کی شناخت کرنے کی اجازت دے سکتا ہے، جو ان مالیکیولر میکانزم کی بصیرت فراہم کرے گا جو پیتھولوجیکل سیلولر ریاستوں کے حصول میں ثالثی کرتے ہیں۔ "
جرنل حوالہ:
- ڈینگ، وائی، بارٹوسووک، ایم، ما، ایس وغیرہ۔ ماؤس اور انسانی ٹشوز میں کرومیٹن کی رسائی کی مقامی پروفائلنگ۔ فطرت، قدرت (2022)۔ ڈی او آئی: 10.1038/s41586-022-05094-1
