Trung tâm Ung thư Aichi và NEC phát triển một phương pháp hiệu quả để xác định kháng nguyên ung thư phổi và tế bào T đặc hiệu với kháng nguyên

Trung tâm Ung thư Aichi và NEC phát triển một phương pháp hiệu quả để xác định kháng nguyên ung thư phổi và tế bào T đặc hiệu với kháng nguyên

TOKYO, ngày 08 tháng 2023 năm 6 – (JCN Newswire) – Trung tâm Ung thư Aichi và nhóm nghiên cứu của Tập đoàn NEC cùng với Đại học Gifu, Đại học Toyama và Trung tâm Y tế Đại học Kitasato, đã phát triển một phương pháp xác định hiệu quả các kháng nguyên ung thư phổi và tế bào T đặc hiệu cho kháng nguyên nhận ra các kháng nguyên thông qua cả phân tích đơn tế bào Lympho xâm nhập khối u (TILs) và hệ thống dự đoán kháng nguyên dựa trên AI của NEC dự đoán phản ứng miễn dịch. Bài báo của chúng tôi mô tả kết quả của nghiên cứu này đã được xuất bản vào ngày 2023 tháng XNUMX năm XNUMX trên “Tạp chí Liệu pháp Miễn dịch Ung thư”, là tạp chí chính thức của Hiệp hội Liệu pháp Miễn dịch Ung thư (SITC) tại Hoa Kỳ.

Trung tâm Ung thư Aichi và NEC phát triển một phương pháp hiệu quả để xác định kháng nguyên ung thư phổi và tế bào T đặc hiệu kháng nguyên PlatoBlockchain Data Intelligence. Tìm kiếm dọc. Ái.
Hình 1. Sơ đồ tổng thể của Nghiên cứu này
Trung tâm Ung thư Aichi và NEC phát triển một phương pháp hiệu quả để xác định kháng nguyên ung thư phổi và tế bào T đặc hiệu kháng nguyên PlatoBlockchain Data Intelligence. Tìm kiếm dọc. Ái.
Hình 2. Phép chiếu và xấp xỉ đa dạng thống nhất (UMAP) của các cấu hình biểu hiện của 6,998 TIL thu được từ ba mô khối u phổi đã được phẫu thuật. TIL được phân loại thành 10 cụm riêng biệt.
Trung tâm Ung thư Aichi và NEC phát triển một phương pháp hiệu quả để xác định kháng nguyên ung thư phổi và tế bào T đặc hiệu kháng nguyên PlatoBlockchain Data Intelligence. Tìm kiếm dọc. Ái.
Hình 3. Tổng cộng có năm kháng nguyên khối u (KK-LC-1, SORL1 đột biến, JAGN1 đột biến, AKT2 đột biến, ITGB5 đột biến) và chín TCR đặc hiệu cho kháng nguyên khối u (hiển thị bằng các màu khác nhau, tổng cộng 140 dòng TCR) đã được xác định.
Trung tâm Ung thư Aichi và NEC phát triển một phương pháp hiệu quả để xác định kháng nguyên ung thư phổi và tế bào T đặc hiệu kháng nguyên PlatoBlockchain Data Intelligence. Tìm kiếm dọc. Ái.
Hình 4. (A) Tái phân nhóm các bản sao TCR (n=140) thể hiện chín TCR. (B) Phân tích biểu hiện của các gen xác định tập hợp con tế bào T trong mỗi kháng nguyên.

Cơ sở nghiên cứu

Ung thư phổi là một trong những bệnh ung thư phổ biến nhất và là một trong những nguyên nhân gây tử vong do ung thư hàng đầu trên toàn thế giới. Có nhiều phương pháp điều trị ung thư, chẳng hạn như phẫu thuật, hóa trị, xạ trị, liệu pháp nhắm mục tiêu phân tử, liệu pháp miễn dịch và sự kết hợp của những phương pháp này. Các chất ức chế điểm kiểm soát miễn dịch (ICI) được phát triển gần đây đã thu hút sự chú ý như một liệu pháp mới và ung thư phổi là một trong những bệnh ung thư nhạy cảm nhất với ICI, nhưng nó chỉ có hiệu quả ở một nhóm nhỏ cá nhân. Theo đó, các liệu pháp miễn dịch hiệu quả mới là cần thiết cho bệnh ung thư phổi.

Các tế bào lympho T gây độc tế bào (CTL) trong TIL là các tế bào miễn dịch quan trọng có thể nhận biết và loại bỏ các tế bào khối u một cách cụ thể. Các kháng nguyên được nhắm mục tiêu bởi CTL bao gồm các kháng nguyên mới dành riêng cho bệnh nhân và các kháng nguyên phổ biến thường được biểu hiện ở những bệnh nhân như kháng nguyên ung thư tinh hoàn (CTA). Nói chung, không dễ để xác định bất kỳ kháng nguyên nào. Nếu các kháng nguyên này có thể được xác định một cách hiệu quả, liệu pháp kết hợp với ICI và liệu pháp miễn dịch đặc hiệu với kháng nguyên có thể nâng cao hiệu quả điều trị.

Nội dung và kết quả của nghiên cứu này

Trong nghiên cứu này của Trung tâm Ung thư Aichi và NEC, chúng tôi đã thực hiện phân tích đơn bào để xác định các đặc điểm TIL của bệnh nhân ung thư phổi không phải tế bào nhỏ (NSCLC) đã được phẫu thuật cắt bỏ (n=3) (Hình 1). Sau đó, chúng tôi chia các TIL thành 10 cụm dựa trên hồ sơ biểu hiện gen và xác định cụm tế bào T cạn kiệt (cụm Tex) được đặc trưng bởi biểu hiện của các gen được gọi là dấu hiệu cạn kiệt (Hình 2). Chúng tôi đã tổng hợp các TCR có trong cụm tế bào T đã cạn kiệt được xác định và đưa từng TCR vào từng tế bào T tương ứng, đồng thời kiểm tra các phản ứng miễn dịch đối với các kháng nguyên mới được dự đoán bởi hệ thống dự đoán kháng nguyên dựa trên AI của NEC và các CTA điển hình. Người ta đã xác nhận rằng hệ thống dự đoán kháng nguyên dựa trên AI của NEC có thể dự đoán chính xác các kháng nguyên gây ra phản ứng miễn dịch và chúng tôi đã xác định được bốn TCR nhận ra KK-LC-1 (một trong các CTA, *2) và năm TCR nhận ra các kháng nguyên mới ( Hình 3).

Nhận xét của nhà nghiên cứu

Tiến sĩ Hirokazu Matsushita, Trưởng khoa Miễn dịch Ung thư Chuyển hóa, Trung tâm Ung thư Aichi
Phối hợp với NEC và các viện nghiên cứu hàng đầu, Trung tâm Ung thư Aichi đã phát triển một quy trình xác định hiệu quả các kháng nguyên và tế bào T đặc hiệu cho kháng nguyên bằng cách sử dụng các mẫu phẫu thuật từ bệnh nhân ung thư. Sắp tới, chúng tôi sẽ thêm một phân tích không gian về môi trường vi mô ung thư có chứa các kháng nguyên và tế bào T đặc hiệu với kháng nguyên vào hệ thống này để làm rõ hơn bản chất của các tế bào T xâm nhập vào ung thư. Ngoài mục tiêu phát triển các liệu pháp miễn dịch ung thư sáng tạo từ những nghiên cứu này, chúng tôi cũng sẽ áp dụng kiến ​​thức thu được cho các bệnh ung thư khác.

Yoshiko Yamashita, Ph.D. Chuyên gia cấp cao, Bộ phận phát triển thuốc AI, Tập đoàn NEC
NEC đang tiến hành thử nghiệm lâm sàng các liệu pháp vắc-xin ung thư được cá nhân hóa nhắm vào các kháng nguyên mới. Chúng tôi tin rằng chúng tôi đã tiến một bước trong việc hiện thực hóa các liệu pháp miễn dịch vắc-xin ung thư được cá nhân hóa tinh vi hơn nữa và thiết kế các liệu pháp tế bào T bằng cách sử dụng phương pháp xác định các tế bào T đặc hiệu cho kháng nguyên được xây dựng trong nghiên cứu này và phương pháp thắt cổ chai thông tin biến đổi chú ý (AVIB) (* 3) để dự đoán tương tác giữa TCR và kháng nguyên bằng cách sử dụng AI mới được phát triển bởi NEC. Chúng tôi sẽ tiếp tục tăng tốc nghiên cứu và phát triển để cung cấp các phương pháp điều trị hiệu quả cho bệnh nhân.

Hỗ trợ nghiên cứu
Nghiên cứu Dự án Ưu tiên của Trung tâm Ung thư Aichi
Tập đoàn NEC
Chương trình trợ cấp nghiên cứu khoa học của Hiệp hội xúc tiến khoa học Nhật Bản
Tổ chức Hô hấp Nhật Bản
Quỹ khoa học đời sống tưởng niệm Uehara

(1) Phân tích đơn bào là một phương pháp phân tích có khả năng phát hiện RNA, là sản phẩm chuyển DNA cho mỗi tế bào, chứ không phải là một khối mô, và hiểu được tính riêng biệt và đa dạng của từng tế bào dựa trên mức độ biểu hiện gen.
(2) KK-LC-1 (Kháng nguyên KitaKyushu Lung Canner-1): Kháng nguyên ung thư và tinh hoàn đã được báo cáo biểu hiện trong bệnh ung thư.
(3) Phương pháp thắt cổ chai thông tin biến đổi chú ý (AVIB): Phương pháp thắt cổ chai thông tin biến đổi được phát triển bởi NEC Laboratories Europe và NEC Laboratories America để dự đoán tương tác giữa TCR và kháng nguyên bằng AI. (bit.ly/43YKys6)

Về NEC Corporation

NEC Corporation đã tự khẳng định mình là công ty đi đầu trong việc tích hợp công nghệ mạng và CNTT đồng thời quảng bá tuyên bố thương hiệu “Tổ chức một thế giới tươi sáng hơn”. NEC cho phép các doanh nghiệp và cộng đồng thích ứng với những thay đổi nhanh chóng diễn ra trong xã hội và thị trường vì nó cung cấp các giá trị xã hội về an toàn, an ninh, công bằng và hiệu quả nhằm thúc đẩy một thế giới bền vững hơn, nơi mọi người đều có cơ hội phát huy hết tiềm năng của mình. Để biết thêm thông tin, hãy truy cập NEC tại www.nec.com.

Dấu thời gian:

Thêm từ Bản tin JCN